Os manguezais de Bocas del Toro são importantes habitat de reprodução e desenvolvimento para muitas espécies das zonas costeiras e marinhas. Estes são manguezais principalmente de comunidades periféricas e de sobrelavado. O primeiro localizado ao longo da costa das ilhas e do istmo, a última crescendo em ilhotas de origem coralino no centro das lagoas.
O mangue-vermelho (Rhizophora mangle, Rhizophoraceae) é a espécie dominante em todos os ambientes e formar populações puras nos caios, onde não há solo exposto para permitir o estabelecimento de outras espécies. As outras espécies, o mangue preto (Avicennia germinans, Avicenniaceae), mangue branco, mangue botão (Laguncularia e Conocarpus erecta, Combretaceae) e mangue pinhuelo (Pelliciera rhizophorae), que crescem em forma dispersas ou formam pequena manchas atrás da faixa de mangue vermelho, ou no centro das ilhotas maiores, onde o solo se formou.
O mangue piñuelo é extremamente interessante, porque no Caribe apenas é representado por populações remanescentes de uma população maior, que ocupou a maior parte do Caribe até antes de que o Istmo Centro-Americano interromper a comunicação entre o Caribe eo Pacífico. Estas populações residuais são muito interessantes do ponto de vista biogeográfico e evolutiva, pois é assumido que tem esta isoladas daquelas do Pacífico, uma vez o fecho do canal da América Central, há cerca de 2,7 milhões de anos.
As comunidades das raízes dos mangues seguem o padrão típico dos manguezais do mundo em áreas que são expostas na maré baixa, onde são comuns: Bostrichia, Caloglossa, Catenella, Murrallela (Taylor, 1979), mas não em seções submersas, onde são substituídos por uma associação dominada por Caulerpa verticillata, C. racemosa, Acanthophora spicifera e Spyridia filamentosa.
(Estudio Ecológico Rápido da regiao do Parque Nacional Marino Isla Bastimentos)