A província de Bocas del Toro tem quatro áreas protegidas, cada uma de uma categoria diferente das cobertas pela Lei Ambiental, que governa a Autoridade Nacional do Ambiente (ANAM) e o Sistema Nacional de Áreas Protegidas (SINAP).

Vale ressaltar que todos eles, em conjunto com o Parque Nacional Volcan Baru, do Pantanal Lagoas de Volcán e a Reserve Floresta Fortuna são os principais componentes da Reserva da Biosfera La Amistad.

Juntas, as áreas protegidas de Bocas del Toro, que estão dentro do SINAP, abrangem uma área de 487.022 hectares de terra (incluindo alguns setores que passaram a Comarca Ngobe-Bugle) mais 11.596 hectares de mar.

As quatro áreas protegidas, que têm um plano de gestão aprovado pela ANAM, são:



Além disso, há várias reservas municipais declaradas, que ainda não pertencem ao SINAP: